MirGeneDB ID | Dmo-Mir-92-P5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-92 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Fruit fly (Drosophila mojavensis) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Dmo-Mir-92-P3 Dmo-Mir-92-P4 Dmo-Mir-92-P6 Dmo-Mir-92-P8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Asu-Mir-92 Bfl-Mir-92-o5 Bla-Mir-92-o5 Cel-Mir-92 Dan-Mir-92-P5 Dme-Mir-92-P5 Dsi-Mir-92-P5 Dya-Mir-92-P5 Esc-Mir-92 Gsp-Mir-92 Hmi-Mir-92 Isc-Mir-92 Obi-Mir-92 Sme-Mir-92 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Drosophila | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (Dmoj_caf1) |
scaffold_6496: 9090312-9090376 [-] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-92-P5) |
Mir-92-P5
scaffold_6496: 9090312-9090376 [-]
Ensembl
Mir-92-P6 scaffold_6496: 9090464-9090534 [-] Ensembl Mir-92-P8 scaffold_6496: 9090674-9090732 [-] Ensembl |
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Seed | AUUGCAC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CAUAAAUAUCGUUUAAAUGUAUCCAUUUUUAGGCCGUGCUAUGUGACAAUAUGUAUUUAAAUUGUAUUUAUCAUAUUGCACAUCUCCCGGCCUACAAGUGUAAAUGCACAAUUCAACUAUGUACAGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 60 CAUAAAUAUCGUUUAAAU C--| U UGCU A UAUUUAAA GUAU CAUUU UAGGCCG AUGUG CAAUAUG U CGUA GUGAA AUCCGGC UACAC GUUAUAC U ACAUGUAUCAACUUAACA AAU^ C CCUC - UAUUUAUG 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Dmo-Mir-92-P5_5p* |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- AGGCCGUGCUAUGUGACAAUAUG -23
Get sequence
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Mature sequence | Dmo-Mir-92-P5_3p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
43- UAUUGCACAUCUCCCGGCCUAC -65
Get sequence
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