| MirGeneDB ID | Dan-Mir-92-P5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-92 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Fruit fly (Drosophila ananassae) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | dan-mir-310 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Dan-Mir-92-P3 Dan-Mir-92-P4 Dan-Mir-92-P6 Dan-Mir-92-P7 Dan-Mir-92-P8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Asu-Mir-92 Bfl-Mir-92-o5 Bla-Mir-92-o5 Cel-Mir-92 Dme-Mir-92-P5 Dmo-Mir-92-P5 Dsi-Mir-92-P5 Dya-Mir-92-P5 Esc-Mir-92 Gsp-Mir-92 Hmi-Mir-92 Isc-Mir-92 Obi-Mir-92 Sme-Mir-92 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Drosophila | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Dana_caf1) |
scaffold_13266: 4133064-4133125 [+] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-92-P5) |
Mir-7
scaffold_13266: 4109379-4109440 [-]
Ensembl
Novel-15 scaffold_13266: 4131702-4131759 [+] Ensembl Mir-92-P7 scaffold_13266: 4132688-4132749 [+] Ensembl Mir-92-P8 scaffold_13266: 4132825-4132881 [+] Ensembl Mir-92-P6 scaffold_13266: 4132944-4133001 [+] Ensembl Mir-92-P5 scaffold_13266: 4133064-4133125 [+] Ensembl |
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| Seed | AUUGCAC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GUGCGAAAAUAGCAAAACAUAAACACUUGCAGGACGGGGAGCGUGACAAUAUAUAUAUUUUAUAAACAUAUAUUGCACACCUCCCGGCCUAUAAGUGUAAAUGUUCCUACAGGUAAAACUUCGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 GUGCGAAAAUAGCAAAA--| AA C ACG C A- UAUAUUU CAU ACACUUG AGG GGGAG GUG CAAUAUA \ GUA UGUGAAU UCC CCCUC CAC GUUAUAU U CUUCAAAAUGGACAUCCUU^ AA A GG- - AC ACAAAUA 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Dan-Mir-92-P5_5p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AGGACGGGGAGCGUGACAAUAUA -23
Get sequence
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| Mature sequence | Dan-Mir-92-P5_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0008425 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
40- UAUUGCACACCUCCCGGCCUAU -62
Get sequence
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