| MirGeneDB ID | Dan-Novel-15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | DAN-NOVEL-15 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Fruit fly (Drosophila ananassae) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | D. ananassae | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | D. ananassae | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Dana_caf1) |
scaffold_13266: 4131702-4131759 [+] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Novel-15) |
Mir-7
scaffold_13266: 4109379-4109440 [-]
Ensembl
Novel-15 scaffold_13266: 4131702-4131759 [+] Ensembl Mir-92-P7 scaffold_13266: 4132688-4132749 [+] Ensembl Mir-92-P8 scaffold_13266: 4132825-4132881 [+] Ensembl Mir-92-P6 scaffold_13266: 4132944-4133001 [+] Ensembl Mir-92-P5 scaffold_13266: 4133064-4133125 [+] Ensembl |
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| Seed | AGUACAC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
AAAGAAAAAAAAAGUUGUUCAUAAUUUCUUAGAACCGGCAUCGUGUAUCUUGUCUUAUUCUCGCACAAGUACACGGUUCCGACUCUAUGUAUUUUGAAACAAUUCUUCUGAAUUAAGUGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 AAAGAAAAAAAAAGUUG---| U UUCU AC C U CUUAU UUCA AAU UAGA CGG AUCGUGUA CUUGU \ AAGU UUA AUCU GCC UGGCACAU GAACA U UGAAUUAAGUCUUCUUAACA^ U UGU- CA U - CGCUC 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Dan-Novel-15_5p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AGAACCGGCAUCGUGUAUCUUGU -23
Get sequence
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| Mature sequence | Dan-Novel-15_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
36- AAGUACACGGUUCCGACUCUAU -58
Get sequence
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