| MirGeneDB ID | Dme-Mir-965 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-965 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | AAGCGUA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Fruit fly (Drosophila melanogaster) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | dme-mir-965 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aae-Mir-965 Bge-Mir-965 Dan-Mir-965 Dma-Mir-965 Dmo-Mir-965 Dpu-Mir-965 Dsi-Mir-965 Dya-Mir-965 Hme-Mir-965 Tca-Mir-965 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Pancrustacea | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Pancrustacea | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Drosophila_melanogaster_BDGP6) |
2L: 243055-243118 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | CAAUCUGGACAAUAUUGCUCAACAUUUUGGGGGGUAAAACUGUACGUUAUAUGUGCCCUUCUGUGAUAUUCAUAAGCGUAUAGCUUUUCCCCUUAAAAGUUAGAGCUAUUGCAACGAAAAGUGUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 60 CAAUCUGGACAAUAUUG-- -| A U - A UGCCCUUC CUC AAC UUUUGGGGGG AAAA CUGUACGUU UAUG \ GAG UUG AAAAUUCCCC UUUU GAUAUGCGA AUAC U UGUGAAAAGCAACGUUAUC A^ - - C - UUAUAGUG 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Dme-Mir-965_5p* |
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| mirBase accession | MIMAT0020861 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- GGGGUAAAACUGUACGUUAUAUG -23
Get sequence
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| Mature sequence | Dme-Mir-965_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0005480 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
42- UAAGCGUAUAGCUUUUCCCCUU -64
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0005480 TargetScanFly: dme-miR-965 |
