| MirGeneDB ID | Dan-Mir-974 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-974 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Fruit fly (Drosophila ananassae) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Dme-Mir-974 Dmo-Mir-974 Dsi-Mir-974 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Drosophila | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Drosophila | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Dana_caf1) |
scaffold_13417: 2478498-2478562 [-] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-974) |
Mir-978-v1
scaffold_13417: 2460540-2460602 [-]
Ensembl
Mir-978-v2 scaffold_13417: 2460541-2460600 [-] Ensembl Mir-977 scaffold_13417: 2467469-2467532 [-] Ensembl Mir-976 scaffold_13417: 2467590-2467647 [-] Ensembl Mir-975 scaffold_13417: 2467720-2467781 [-] Ensembl Mir-974 scaffold_13417: 2478498-2478562 [-] Ensembl Mir-973 scaffold_13417: 2478669-2478737 [-] Ensembl |
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| Seed | AGCGAGC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
AAUCCUGGCUUGGGGUAGGUCAUCUCCUCUAAGCGAGCAAAGAAGUAGUAUUUGUUUGCUUUUAAUGGUCAAAUAUAACUUUUUUGGAAGCUACGAGGAGUUGUCCUCAGCGCUUAUGAAAUCGAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 AAUCCUGGCUUGGGGUA--| U U UA GAG A UGUUUGCUU GG CA CUCCUC AGC CAAAGAAGU GUAUU \ CC GU GAGGAG UCG GUUUUUUCA UAUAA U AGCUAAAGUAUUCGCGACU^ U U CA AAG A ACUGGUAAU 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UGUG in loop | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Dan-Mir-974_5p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AAGCGAGCAAAGAAGUAGUAUU -22
Get sequence
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| Star sequence | Dan-Mir-974_3p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
43- UAUAACUUUUUUGGAAGCUACG -65
Get sequence
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