| MirGeneDB ID | Csc-Mir-10-P2r1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Family name | MIR-10 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Arizona bark scorpion (Centruroides sculpturatus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Csc-Mir-10-P1q1-v1 Csc-Mir-10-P1q2-v1 Csc-Mir-10-P1q3-v1 Csc-Mir-10-P1r Csc-Mir-10-P2r2 Csc-Mir-10-P3r1 Csc-Mir-10-P3r2 Csc-Mir-10-P4q Csc-Mir-10-P4r | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aae-Mir-10-P2 Adi-Mir-10 Aga-Mir-10-P2 Agr-Mir-10-P2 Asp-Mir-10 Bfl-Mir-10-P2-v1 Bge-Mir-10-P2 Bko-Mir-10-P2 Bla-Mir-10-P2-v1 Bpl-Mir-10-P2 Cbr-Mir-10-P2 Cel-Mir-10-P2 Cin-Mir-10-P2 Cte-Mir-10-P2 Dan-Mir-10-P2 Dgr-Mir-10-P2 Dlo-Mir-10-P2 Dma-Mir-10-P2 Dme-Mir-10-P2 Dmo-Mir-10-P2 Dpu-Mir-10-P2 Dsi-Mir-10-P2 Dya-Mir-10-P2 Eba-Mir-10-P2 Gpa-Mir-10-P2 Gsp-Mir-10-P2 Hru-Mir-10-P2 Isc-Mir-10-P2 Lan-Mir-10-P2 Lgi-Mir-10-P2 Lhy-Mir-10-P2 Llo-Mir-10-P2 Mgi-Mir-10-P2 Mom-Mir-10-P2 Npo-Mir-10-P2 Nve-Mir-10 Obi-Mir-10-P2 Ofu-Mir-10-P2 Ovu-Mir-10-P2 Pau-Mir-10-P2 Pca-Mir-10-P2 Pdu-Mir-10-P2 Pfl-Mir-10-P2 Ple-Mir-10-P2 Pmi-Mir-10-P2 Pve-Mir-10-P2 Rph-Mir-10-P2 Sko-Mir-10-P2 Snu-Mir-10-P2 Tca-Mir-10-P2 Tur-Mir-10-P2 Xbo-Mir-10-P2 Xbo-Mir-10-P2-as | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | C. sculpturatus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eumetazoa | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCF_000671375.1_CSC) |
NW_019384344.1: 388111-388173 [+] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-10-P2r1) |
Mir-10-P2r2
NW_019384344.1: 385704-385766 [+]
Ensembl
Let-7-P18b NW_019384344.1: 386477-386544 [+] Ensembl Mir-10-P2r1 NW_019384344.1: 388111-388173 [+] Ensembl Let-7-P18a NW_019384344.1: 388884-388951 [+] Ensembl Mir-10-P3r2 NW_019384344.1: 391437-391492 [+] Ensembl Mir-10-P3r1 NW_019384344.1: 397903-397958 [+] Ensembl |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | ACCCGUA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UGCCUCUGACAUCAGUUGCCAUCACGCCUUAACCCGUAGAUCCGAACUUGUGUUGUUAAAUAGUCUAACCACAAGGUCGAUUCUAUGGGUCCAGGUUGGAUGGAUAAUUACGAACGAAUCUUCGet precursor sequence |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 60 UGCCUCUGACAUCAGUUG--| AC UA UC A UUGUUAAA CCAUC GCCU ACCCGUAGA CGA CUUGUG \ GGUAG UGGA UGGGUAUCU GCU GAACAC U CUUCUAAGCAAGCAUUAAUA^ GU CC UA G CAAUCUGA 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UG at 5p(-14) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mature sequence | Csc-Mir-10-P2r1_5p |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AACCCGUAGAUCCGAACUUGUG -22
Get sequence
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Star sequence | Csc-Mir-10-P2r1_3p* |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
41- CAAGGUCGAUUCUAUGGGUCCA -63
Get sequence
|
