MirGeneDB 3.0

40 microRNA genes with node of origin R. norvegicus

						Sort by genome coordinates								Motifs
MirGeneDB ID ▲	MiRBase ID	Family	Seed	5p accession	3p accession	Chromosome	Start	End	Strand	Node of origin (locus)	Node of origin (family)	Iso­miR	3' NTU	UG	UGUG	CNNC
Rno-Mir-15-P1c3	rno-mir-322-1	MIR-15	AGCAGCA	MIMAT0001619	MIMAT0000547	chrX	158584564	158584621	+	R. norvegicus	Olfactores		No
Rno-Mir-15-P1c4	rno-mir-322-2	MIR-15	AGCAGCA	MIMAT0001619	MIMAT0000547	chrX	158148183	158148240	+	R. norvegicus	Olfactores		No
Rno-Mir-15-P2c3	rno-mir-503-1	MIR-15	AGCAGCG	MIMAT0003213	MIMAT0017224	chrX	158584862	158584924	+	R. norvegicus	Olfactores		No			1
Rno-Mir-15-P2c4	rno-mir-503-2	MIR-15	AGCAGCG	MIMAT0003213	MIMAT0017224	chrX	158148481	158148543	+	R. norvegicus	Olfactores		No			1
Rno-Mir-29-P1d5 V	rno-mir-29b-2	MIR-29	AGCACCA	MIMAT0004717	MIMAT0000801	chr13	113782066	113782130	+	R. norvegicus	Bilateria	2	No			1
Rno-Mir-29-P1d6 V	rno-mir-29b-2	MIR-29	AGCACCA	MIMAT0004717	MIMAT0000801	chr1	38238385	38238449	+	R. norvegicus	Bilateria	2	No			1
Rno-Mir-29-P2d5	rno-mir-29c-1	MIR-29	AGCACCA	MIMAT0003154	MIMAT0000803	chr13	113782602	113782659	+	R. norvegicus	Bilateria		No			1
Rno-Mir-29-P2d6	rno-mir-29c-2	MIR-29	AGCACCA	MIMAT0003154	MIMAT0000803	chr1	38238921	38238978	+	R. norvegicus	Bilateria		No			1
Rno-Mir-190-P1c	rno-mir-190a-1	MIR-190	GAUAUGU	MIMAT0000865	MIMAT0017145	chr8	80928179	80928237	+	R. norvegicus	Bilateria		No	1		1
Rno-Mir-190-P1d	rno-mir-190a-2	MIR-190	GAUAUGU	MIMAT0000865	MIMAT0017145	chr8	73030059	73030117	-	R. norvegicus	Bilateria		No	1		1
Rno-Mir-196-P1c	rno-mir-196b-1	MIR-196	AGGUAGU	MIMAT0001082	MIMAT0017171	chr4	82284863	82284920	-	R. norvegicus	Olfactores		No			1
Rno-Mir-196-P1d	rno-mir-196b-2	MIR-196	AGGUAGU	MIMAT0001082	MIMAT0017171	chr4	82199068	82199125	-	R. norvegicus	Olfactores		No			1
Rno-Mir-340-P1	rno-mir-340-1	MIR-340	UAUAAAG	MIMAT0004650	MIMAT0000585	chr10	35559001	35559065	+	R. norvegicus	Eutheria		No	1		1
Rno-Mir-340-P2	rno-mir-340-2	MIR-340	UAUAAAG	MIMAT0004650	MIMAT0000585	chr10	35571773	35571837	+	R. norvegicus	Eutheria		No	1		1
Rno-Mir-350-P1	rno-mir-350-1	MIR-350	AAGUGCA	None	MIMAT0000604	chr13	43827515	43827575	+	R. norvegicus	Eutheria		No		1	1
Rno-Mir-350-P2	rno-mir-350-2	MIR-350	AAGUGCA	None	MIMAT0000604	chr13	94849831	94849891	-	R. norvegicus	Eutheria		No		1	1
Rno-Mir-351-P1a	rno-mir-351-1	MIR-351	CCCUGAG	MIMAT0000608	MIMAT0017041	chrX	158585602	158585661	+	R. norvegicus	Muridae		No			1
Rno-Mir-351-P1b	rno-mir-351-2	MIR-351	CCCUGAG	MIMAT0000608	MIMAT0017041	chrX	158149221	158149280	+	R. norvegicus	Muridae		No			1
Rno-Mir-430-P6a	rno-mir-295-1	MIR-430	AAGUGCU	MIMAT0012849	MIMAT0017366	chr1	66133322	66133380	-	R. norvegicus	Vertebrata		No
Rno-Mir-430-P6b	rno-mir-295-2	MIR-430	AAGUGCU	MIMAT0012849	MIMAT0017366	chr1	64536633	64536691	-	R. norvegicus	Vertebrata		No
Rno-Mir-450-P1a	rno-mir-450b-1	MIR-450	UUUGCGA	MIMAT0035746	MIMAT0035747	chrX	158589644	158589700	+	R. norvegicus	Eutheria		No		1
Rno-Mir-450-P1b	rno-mir-450b-2	MIR-450	UUUGCGA	MIMAT0035746	MIMAT0035747	chrX	158153261	158153317	+	R. norvegicus	Eutheria		No		1
Rno-Mir-450-P2a	None	MIR-450	UUGGGAA	None	None	chrX	158589777	158589833	+	R. norvegicus	Eutheria		No		1
Rno-Mir-450-P2b	rno-mir-450a	MIR-450	UUUGCGA	MIMAT0001547	MIMAT0017183	chrX	158153394	158153450	+	R. norvegicus	Eutheria		No		1
Rno-Mir-450-P3a	None	MIR-450	UUUGCAG	None	None	chrX	158589938	158589994	+	R. norvegicus	Eutheria		Unknown
Rno-Mir-450-P3b	None	MIR-450	UUUGCAG	None	None	chrX	158153555	158153611	+	R. norvegicus	Eutheria		Unknown
Rno-Mir-506-P25	rno-mir-3551	MIR-506	CUUCACC	MIMAT0017809	MIMAT0017810	chrX	151272836	151272891	-	R. norvegicus	Eutheria		No
Rno-Mir-542-P1a	rno-mir-542-1	MIR-542	GUGACAG	MIMAT0003178	MIMAT0003179	chrX	158588539	158588599	+	R. norvegicus	Eutheria		No			1
Rno-Mir-542-P1b	rno-mir-542-3	MIR-542	GUGACAG	MIMAT0003178	MIMAT0003179	chrX	158158895	158158955	+	R. norvegicus	Eutheria		No			1
Rno-Mir-542-P1c	rno-mir-542-2	MIR-542	GUGACAG	MIMAT0003178	MIMAT0003179	chrX	158152156	158152216	+	R. norvegicus	Eutheria		No			1
Rno-Mir-598-P1	rno-mir-598-1	MIR-598	ACGUCAU	MIMAT0005324	MIMAT0005325	chr15	47057506	47057564	+	R. norvegicus	Eutheria		No	1		1
Rno-Mir-598-P2	rno-mir-598-2	MIR-598	ACGUCAU	MIMAT0005324	MIMAT0005325	chr15	46893167	46893225	+	R. norvegicus	Eutheria		No	1		1
Rno-Mir-1962-P1	None	MIR-1962	GAGGCUG	None	None	chr1	207802815	207802877	+	R. norvegicus	Muridae		Unknown			1
Rno-Mir-1962-P2	None	MIR-1962	GAGGCUG	None	None	chr1	207848066	207848128	+	R. norvegicus	Muridae		Unknown			1
Rno-Mir-3558	rno-mir-3558	MIR-3558	CAUAGAA	MIMAT0017825	MIMAT0017826	chr6	10992716	10992779	+	R. norvegicus	R. norvegicus		No
Rno-Mir-3559	rno-mir-3559	MIR-3559	GACAGAC	MIMAT0017827	MIMAT0017828	chrX	75459266	75459327	-	R. norvegicus	R. norvegicus		No
Rno-Mir-3580	rno-mir-3580	MIR-3580	GACUAGG	MIMAT0017868	MIMAT0017869	chrX	151295627	151295682	-	R. norvegicus	R. norvegicus		No			1
Rno-Mir-3593	rno-mir-3593	MIR-3593	UUCAACC	MIMAT0017896	MIMAT0017897	chr6	76661814	76661867	-	R. norvegicus	R. norvegicus		No			1
Rno-Mir-6324	rno-mir-6324	MIR-6324	GCUCUGC	None	MIMAT0025063	chr11	36383558	36383621	-	R. norvegicus	R. norvegicus		No		1
Rno-Mir-6329	rno-mir-6329	MIR-6329	AUGUGAC	MIMAT0025068	None	chr8	56629614	56629670	-	R. norvegicus	R. norvegicus		No			1

(red - mature/co-mature, blue - star)

Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all