Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MirGeneDB ID ▲ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Dr | Dr | Ad | Bi | Bi | Bi | Bi | Br | Br | Br | Br | Ce | Ce | Ce | Ce | Co | Co | Co | Co | Du | Du | Du | Du | Fa | He | He | He | Hi | Hi | Il | Il | Je | Je | Ki | Ki | Ki | Ki | Ki | La | Li | Li | Li | Li | Li | Li | Lu | Me | Me | Mu | Ov | Pa | Pa | Pa | Sk | Sm | So | So | So | So | Sp | St | St | St | St | Te | Te | Th | Ut | Wh | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Rno-Mir-450-P1a | rno-mir-450b-1 | MIR-450 | UUUGCGA | MIMAT0035746 | MIMAT0035747 | chrX | 158589644 | 158589700 | + | R. norvegicus | Eutheria | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Rno-Mir-450-P1b | rno-mir-450b-2 | MIR-450 | UUUGCGA | MIMAT0035746 | MIMAT0035747 | chrX | 158153261 | 158153317 | + | R. norvegicus | Eutheria | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Rno-Mir-450-P2a | None | MIR-450 | UUGGGAA | None | None | chrX | 158589777 | 158589833 | + | R. norvegicus | Eutheria | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Rno-Mir-450-P2b | rno-mir-450a | MIR-450 | UUUGCGA | MIMAT0001547 | MIMAT0017183 | chrX | 158153394 | 158153450 | + | R. norvegicus | Eutheria | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Rno-Mir-450-P3a | None | MIR-450 | UUUGCAG | None | None | chrX | 158589938 | 158589994 | + | R. norvegicus | Eutheria | Unknown | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Rno-Mir-450-P3b | None | MIR-450 | UUUGCAG | None | None | chrX | 158153555 | 158153611 | + | R. norvegicus | Eutheria | Unknown |
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all