MirGeneDB ID | Sha-Mir-7304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-7304 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Tasmanian devil (Sarcophilus harrisii) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Mdo-Mir-7304 Neu-Mir-7304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Marsupialia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Marsupialia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (DEVIL_add) |
GL849772.1: 44094-44152 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-7304) |
Mir-430-P51
GL849772.1: 42803-42860 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-7303-P2 GL849772.1: 43147-43201 [-] UCSC Ensembl Mir-1541 GL849772.1: 43949-44008 [-] UCSC Ensembl Mir-7304 GL849772.1: 44094-44152 [-] UCSC Ensembl Mir-7303-P1-v1 GL849772.1: 44547-44605 [-] UCSC Ensembl Mir-7303-P1-v2 GL849772.1: 44547-44605 [-] UCSC Ensembl |
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Seed | AUGGGGU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
ACCUGUGCCCCUUGCAGUCUCAACUGCCUCAUUCAUACCACACUCUCAUUCUUAUCUGUAUCUAGAAUGGGGUGUCCUGGUGUGAAUGAUUCUGUUGAGGAUUCAUCAACCCGCAACGCGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 ACCUGUGCCCCUUGCAG-- UGCC ---| U UAUCU UCUCAAC UCAUUCAUACC ACACUC CAUUCU \ GGAGUUG AGUAAGUGUGG UGUGGG GUAAGA G CGCAACGCCCAACUACUUA UCUU UCC^ - UCUAU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Sha-Mir-7304_5p* |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- AUUCAUACCACACUCUCAUUCU -22
Get sequence
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Mature sequence | Sha-Mir-7304_3p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
35- AAUGGGGUGUCCUGGUGUGAAUGA -59
Get sequence
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