MirGeneDB ID | Neu-Mir-7304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-7304 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Tammar Wallaby (Notamacropus eugenii) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Mdo-Mir-7304 Sha-Mir-7304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Marsupialia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Marsupialia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCA_028372415.1_mMacEug1.pri) |
CM051817.1: 18383978-18384036 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-7304) |
Mir-430-P51
CM051817.1: 18382539-18382598 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-7303-P2 CM051817.1: 18382853-18382907 [-] UCSC Ensembl Mir-1541 CM051817.1: 18383837-18383896 [-] UCSC Ensembl Mir-7304 CM051817.1: 18383978-18384036 [-] UCSC Ensembl Novel-6 CM051817.1: 18384377-18384433 [-] UCSC Ensembl Mir-7303-P1-v1 CM051817.1: 18384511-18384569 [-] UCSC Ensembl Mir-7303-P1-v2 CM051817.1: 18384511-18384569 [-] UCSC Ensembl |
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Seed | AUGGGGU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CAACCUGUGCCCUCCAGUCUCAACUGCCUUAUUCAUACCACACUCUCAUUCUUAUCUGUAUCUAGAAUGGGGUGUCCUGGUGUGAAUGAUUCUGUUGAGGAUUCAUCAACCUGCAAUCGGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 CAACCUGUGCCCUCCAG-- UGCC ---| U UAUCU UCUCAAC UUAUUCAUACC ACACUC CAUUCU \ GGAGUUG AGUAAGUGUGG UGUGGG GUAAGA G GCUAACGUCCAACUACUUA UCUU UCC^ - UCUAU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Neu-Mir-7304_5p* |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- AUUCAUACCACACUCUCAUUCU -22
Get sequence
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Mature sequence | Neu-Mir-7304_3p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
35- AAUGGGGUGUCCUGGUGUGAAUGA -59
Get sequence
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