| MirGeneDB ID | Sha-Mir-1251 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-1251 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Tasmanian devil (Sarcophilus harrisii) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-1251 Cfa-Mir-1251 Cja-Mir-1251 Cpo-Mir-1251 Dno-Mir-1251 Eca-Mir-1251 Ete-Mir-1251 Hsa-Mir-1251 Laf-Mir-1251 Mdo-Mir-1251 Mml-Mir-1251 Mmr-Mir-1251 Mmu-Mir-1251 Neu-Mir-1251 Ocu-Mir-1251 Pab-Mir-1251 Rno-Mir-1251 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Theria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Theria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (DEVIL_add) |
GL861598.1: 2793465-2793523 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | CUCUAGC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CCUCCCUCCCCUAACAGAUCAGCUAUGUAGACUCUAGCUGACUAAGGCGCUUCUCUUUCUAAAAAGAGCGCUUUACUUAGCCAGUGUAGACAUGGCCUGAUGAACAUUGGAACUACUUCGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 CCUCCCUCCCCUAACAG- -| AG U A C UCUCUUU AUCA GCUAUGU AC CU GCUGA UAAGGCGCU \ UAGU CGGUACA UG GA CGAUU AUUUCGCGA C CUUCAUCAAGGUUACAAG C^ GA U C C GAAAAAU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Sha-Mir-1251_5p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- ACUCUAGCUGACUAAGGCGCU -21
Get sequence
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| Star sequence | Sha-Mir-1251_3p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
38- CGCUUUACUUAGCCAGUGUAG -59
Get sequence
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