| MirGeneDB ID | Neu-Mir-1251 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-1251 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Tammar Wallaby (Notamacropus eugenii) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-1251 Cfa-Mir-1251 Cja-Mir-1251 Cpo-Mir-1251 Dno-Mir-1251 Eca-Mir-1251 Ete-Mir-1251 Hsa-Mir-1251 Laf-Mir-1251 Mdo-Mir-1251 Mml-Mir-1251 Mmr-Mir-1251 Mmu-Mir-1251 Ocu-Mir-1251 Pab-Mir-1251 Rno-Mir-1251 Sha-Mir-1251 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Theria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Theria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_028372415.1_mMacEug1.pri) |
CM051815.1: 280285956-280286014 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | CUCUAGC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CCCUCCUUUCCCCAACGAUCAGCUAUGUAGACUCUAGCUGACUAAGGCGCUUCUCUUUCUAAAAAGAGCGCUUUACUUAGCCAGUGUAGACAUGGCCUGAUGAACAUUGGAACCACUUCGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 CCCUCCUUUCCCCAACG- -| AG U A C UCUCUUU AUCA GCUAUGU AC CU GCUGA UAAGGCGCU \ UAGU CGGUACA UG GA CGAUU AUUUCGCGA C CUUCACCAAGGUUACAAG C^ GA U C C GAAAAAU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Neu-Mir-1251_5p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- ACUCUAGCUGACUAAGGCGCU -21
Get sequence
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| Star sequence | Neu-Mir-1251_3p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
38- CGCUUUACUUAGCCAGUGUAG -59
Get sequence
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