| MirGeneDB ID | Neu-Mir-671 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-671 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Tammar Wallaby (Notamacropus eugenii) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-671 Cfa-Mir-671 Cja-Mir-671 Cpo-Mir-671 Dno-Mir-671 Eca-Mir-671 Ete-Mir-671 Hsa-Mir-671 Laf-Mir-671 Mml-Mir-671 Mmr-Mir-671 Mmu-Mir-671 Ocu-Mir-671 Pab-Mir-671 Rno-Mir-671 Sha-Mir-671 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Theria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Theria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_028372415.1_mMacEug1.pri) |
CM051815.1: 94797472-94797531 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | GGAAGCC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UGGCCGGGGAACUGGCUGGACAGGAAGAAGAGGAAGCCCUUGAGGGGCUAGAGGUGCUAGAUGUUUUUCUACGCUUCUCUGGACUGCACCUUUUUCGUGCAGUUGAGCCAGGCCUGGUGCGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 UGGCCGGGGAACUGGCUGGA-| G AGGA C UU - UGCUA CA GAAGAAG AG CC GAGGGGC UAGAGG \ GU CUUUUUC UC GG CUCUUCG AUCUUU G CGUGGUCCGGACCGAGUUGAC^ G CACG A U- C UUGUA . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UG at 5p(-14) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Neu-Mir-671_5p (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AGGAAGCCCUUGAGGGGCUAGAGG -24
Get sequence
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| Co-mature sequence | Neu-Mir-671_3p (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
36- UUCUACGCUUCUCUGGACUGCACC -60
Get sequence
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