MirGeneDB ID | Mmu-Mir-671 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-671 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | House mouse (Mus musculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | mmu-mir-671 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Bta-Mir-671 Cfa-Mir-671 Cja-Mir-671 Cpo-Mir-671 Dno-Mir-671 Eca-Mir-671 Ete-Mir-671 Hsa-Mir-671 Laf-Mir-671 Mml-Mir-671 Mmr-Mir-671 Neu-Mir-671 Ocu-Mir-671 Pab-Mir-671 Rno-Mir-671 Sha-Mir-671 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Theria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Theria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (mm10) |
chr5: 24592132-24592191 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | GGAAGCC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UGGCUGGCGAACUGGCAGGCCAGGAAGAGGAGGAAGCCCUGGAGGGGCUGGAGGUGAUGGAUGUUUUCCUCCGGUUCUCAGGGCUCCACCUCUUUCGAGCCGUAGAGCCAGGGCUGGUGCGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 60 UGGCUGGCGAACUGGCA--| CA A A GA UGAUGG GGC GGAAGAGG GGA GCCCUG GGGGCUGGAGG \ CCG CUUUCUCC CCU CGGGAC UCUUGGCCUCC A CGUGGUCGGGACCGAGAUG^ AG A - -- UUUUGU . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Mmu-Mir-671_5p |
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mirBase accession | MIMAT0003731 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- AGGAAGCCCUGGAGGGGCUGGAGG -24
Get sequence
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Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0003731 TargetScanVert: mmu-miR-671-5p miRDB: MIMAT0003731 |
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Star sequence | Mmu-Mir-671_3p* |
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mirBase accession | MIMAT0004821 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
39- UCCGGUUCUCAGGGCUCCACC -60
Get sequence
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Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0004821 TargetScanVert: mmu-miR-671-3p miRDB: MIMAT0004821 |