| MirGeneDB ID | Mmr-Mir-506-P4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-506 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Gray mouse lemur (Microcebus murinus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Mmr-Mir-506-P1o1 Mmr-Mir-506-P1o2 Mmr-Mir-506-P2a Mmr-Mir-506-P2b Mmr-Mir-506-P3 Mmr-Mir-506-P5 Mmr-Mir-506-P6o5 Mmr-Mir-506-P6o6 Mmr-Mir-506-P6o7 Mmr-Mir-506-P6o8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-506-P4b Cfa-Mir-506-P4b Cja-Mir-506-P4 Cpo-Mir-506-P4 Dno-Mir-506-P4 Eca-Mir-506-P4a Eca-Mir-506-P4b Hsa-Mir-506-P4 Laf-Mir-506 Mml-Mir-506-P4 Mmu-Mir-506-P4 Ocu-Mir-506-P4 Pab-Mir-506-P4 Rno-Mir-506-P4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_000165445.3_Mmur_3.0_genomic) |
CM007693.1: 124102183-124102240 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-506-P4) |
Mir-506-P5
CM007693.1: 124061442-124061499 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-506-P4 CM007693.1: 124102183-124102240 [-] UCSC Ensembl Mir-506-P2b CM007693.1: 124102496-124102553 [-] UCSC Ensembl Mir-506-P3 CM007693.1: 124122426-124122485 [-] UCSC Ensembl Mir-506-P2a CM007693.1: 124127809-124127866 [-] UCSC Ensembl |
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| Seed | GAAUGGC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CCACCUUCAGCCAUACUGUGGGCAGUGCCCCACUCAGGAAGGCAUCAUUCACAUAGAAGGACAUAUGAAUGGCGCCUUUCUGAGUAGUGUAAUGUGCAACAUGGACAGCAUUUGUGGUGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 CCACCUUCAGCCAUACUG--| G G CCC AU CAUAGA UG GCA UGC ACUCAGGAAGGC CAUUCA A AC UGU AUG UGAGUCUUUCCG GUAAGU G UGGUGUUUACGACAGGUACA^ G A UGA CG AUACAG 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UG at 5p(-14), CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Mmr-Mir-506-P4_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CACUCAGGAAGGCAUCAUUCACA -23
Get sequence
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| Mature sequence | Mmr-Mir-506-P4_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
35- UGAAUGGCGCCUUUCUGAGUAGU -58
Get sequence
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