| MirGeneDB ID | Mmr-Mir-506-P1o2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-506 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Gray mouse lemur (Microcebus murinus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Mmr-Mir-506-P1o1 Mmr-Mir-506-P2a Mmr-Mir-506-P2b Mmr-Mir-506-P3 Mmr-Mir-506-P4 Mmr-Mir-506-P5 Mmr-Mir-506-P6o5 Mmr-Mir-506-P6o6 Mmr-Mir-506-P6o7 Mmr-Mir-506-P6o8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Cfa-Mir-506-P1 Eca-Mir-506-P1o-v1 Laf-Mir-506 Rno-Mir-506-P1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | M. murinus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_000165445.3_Mmur_3.0_genomic) |
CM007693.1: 124175568-124175625 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-506-P1o2) |
Mir-506-P2a
CM007693.1: 124127809-124127866 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-506-P1o2 CM007693.1: 124175568-124175625 [-] UCSC Ensembl Mir-506-P1o1 CM007693.1: 124221530-124221587 [-] UCSC Ensembl |
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| Seed | UUGAAAC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CCAUUAUCAGGCAUGCUGUGUGUGGUACCCUGCUCCAGAGAGUAGCAAUCAUAUGUAAUUACUUAUGAUUGAAACCUCUGUGAGUGGAGUAACACAUGACACAUACGACAUAUGCCAUGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 CCAUUAUCAGGCAUGCU- - G C UG -| A AG UAUGUA GU GUGUG UAC C CUC CAGAG GU CAAUCA A CA UACAC AUG G GAG GUCUC CA GUUAGU U UACCGUAUACAGCAUACA G A A GU U^ - AA AUUCAU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UG at 5p(-14), CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Mmr-Mir-506-P1o2_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UGCUCCAGAGAGUAGCAAUCA -21
Get sequence
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| Mature sequence | Mmr-Mir-506-P1o2_3p (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
37- AUUGAAACCUCUGUGAGUGGA -58
Get sequence
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