MirGeneDB ID | Mmr-Mir-370 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Family name | MIR-370 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Gray mouse lemur (Microcebus murinus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Bta-Mir-370 Cfa-Mir-370 Cja-Mir-370 Cpo-Mir-370 Eca-Mir-370 Hsa-Mir-370 Mml-Mir-370 Mmu-Mir-370 Ocu-Mir-370 Pab-Mir-370 Rno-Mir-370 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Boreoeutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Boreoeutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCA_000165445.3_Mmur_3.0_genomic) |
CM007663.1: 12611252-12611308 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-370) |
Mir-493
CM007663.1: 12574249-12574311 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-337-v1 CM007663.1: 12577986-12578046 [+] UCSC Ensembl Mir-337-v2 CM007663.1: 12577986-12578046 [+] UCSC Ensembl Mir-431 CM007663.1: 12583662-12583725 [+] UCSC Ensembl Mir-433 CM007663.1: 12584521-12584594 [+] UCSC Ensembl Mir-127 CM007663.1: 12585625-12585680 [+] UCSC Ensembl Mir-432 CM007663.1: 12587123-12587191 [+] UCSC Ensembl Mir-136-v2 CM007663.1: 12587343-12587398 [+] UCSC Ensembl Mir-136-v1 CM007663.1: 12587343-12587398 [+] UCSC Ensembl Mir-370 CM007663.1: 12611252-12611308 [+] UCSC Ensembl |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | CCUGCUG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CGCACAAGUCGGGGCACAAGACAGAGAGGCCAGGUCACGUCCCUGCAGUUACACAGCUCAUGAGUGCCUGCUGGGGUGGAACCUGGUCUGUCUGUCUGUCUAGCACCACGGCGCUGGGet precursor sequence |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 CGCACAAGUCGGGGCACA--| G CA GU U U ACAGC AGACAGA AGGCCAGGU C CCC GCAG UAC \ UCUGUCU UCUGGUCCA G GGG CGUC GUG U GGUCGCGGCACCACGAUCUG^ G AG UG U C AGUAC 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Star sequence | Mmr-Mir-370_5p* |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- CAGGUCACGUCCCUGCAGUUAC -22
Get sequence
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mature sequence | Mmr-Mir-370_3p |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
35- GCCUGCUGGGGUGGAACCUGGU -57
Get sequence
|