| MirGeneDB ID | Mmr-Mir-1301 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-1301 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Gray mouse lemur (Microcebus murinus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-1301 Cfa-Mir-1301 Cja-Mir-1301 Cpo-Mir-1301 Dno-Mir-1301 Eca-Mir-1301 Ete-Mir-1301 Hsa-Mir-1301 Mml-Mir-1301 Pab-Mir-1301 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_000165445.3_Mmur_3.0_genomic) |
CM007668.1: 137118975-137119032 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UGCAGCU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CAAGUAGCCCCUAGAAUGGGGCUUGUGGGGGGUCACUGUAGGCACCACCGCUGUGCUGGGGAUGUUGCAGCUGCCUGGGAGUGACUUCACACAGUCCUCCCUGCCUGCAGGCUCCCCCGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 CAAGUAGCCCCUAGAAU---| U G G- CCACC GCUGG GGGGCU GUG GGGGUCACU UAGGCA GCUGU G UCCUGA CAC CUUCAGUGA GUCCGU CGACG G CCCCCUCGGACGUCCGUCCC^ - A GG ----- UUGUA 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UG at 5p(-14), CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Mmr-Mir-1301_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- GGUCACUGUAGGCACCACCGCUGUG -25
Get sequence
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| Mature sequence | Mmr-Mir-1301_3p (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
34- UUGCAGCUGCCUGGGAGUGACUUC -58
Get sequence
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