| MirGeneDB ID | Ete-Mir-1301 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-1301 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Lesser hedgehog tenrec (Echinops telfairi) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-1301 Cfa-Mir-1301 Cja-Mir-1301 Cpo-Mir-1301 Dno-Mir-1301 Eca-Mir-1301 Hsa-Mir-1301 Mml-Mir-1301 Mmr-Mir-1301 Pab-Mir-1301 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (echTel2) |
JH980293: 22580093-22580152 [-] UCSC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UGCAGCU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CAGGCGACCCCUGGAAUGGGGAUUGUGGGGGGUCACUCUAGGCACCGCAGCACUGUGCUGGGGAUGUUGCAGCUGCCUGGGAGUGAUUCCACACAGUCCUCUCUGCCUCCAGGGUCACCCGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 CAGGCGACCCCUGGAAU-- G - CC-| CUGUG GGGGAUUGUG GGGGUCACU CUAGGCA GCAGCA C CUCCUGACAC CCUUAGUGA GGUCCGU CGUUGU U CCCACUGGGACCUCCGUCU A G CGA^ AGGGG . 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UG at 5p(-14), CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Ete-Mir-1301_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- GGUCACUCUAGGCACCGCAGCA -22
Get sequence
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| Mature sequence | Ete-Mir-1301_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
36- UUGCAGCUGCCUGGGAGUGAUUCC -60
Get sequence
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