| MirGeneDB ID | Mmr-Mir-105-P1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-105 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Gray mouse lemur (Microcebus murinus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Mmr-Mir-105-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-105-P1 Cfa-Mir-105-P1 Cja-Mir-105-P1 Cpo-Mir-105-P1 Eca-Mir-105-P1 Ete-Mir-105-P1 Hsa-Mir-105-P1 Mml-Mir-105-P1 Mmu-Mir-105-P1 Ocu-Mir-105-P1 Pab-Mir-105-P1 Rno-Mir-105-P1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_000165445.3_Mmur_3.0_genomic) |
CM007693.1: 73484625-73484683 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-105-P1) |
Mir-105-P2
CM007693.1: 73482043-73482101 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-105-P1 CM007693.1: 73484625-73484683 [-] UCSC Ensembl |
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| Seed | CAAAUGC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GUUACAGGAUCUUCUGAGUGUGCAUCGUGGUCAAAUGCUCAGACUCCUGUGGUGGAUGCUUAUGCACCACGGAUGUUUGAGCAUGUGCUAUGGUGUCUACUUUUGCAACACUGCCAUCUGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 GUUACAGGAUCUUCUGA--| U U A UC GAUG GUG GCAUCGUGG CA AUGCUCAGAC CUGUGGUG C CAU UGUGGUAUC GU UACGAGUUUG GGCACCAC U UCUACCGUCACAACGUUUU^ C - G UA GUAU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Mmr-Mir-105-P1_5p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UCAAAUGCUCAGACUCCUGUGGUG -24
Get sequence
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| Star sequence | Mmr-Mir-105-P1_3p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
36- CCACGGAUGUUUGAGCAUGUGCU -59
Get sequence
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