MirGeneDB ID | Mml-Mir-105-P1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-105 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | CAAAUGC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Rhesus monkey (Macaca mulatta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | mml-mir-105-2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Mml-Mir-105-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Bta-Mir-105-P1 Cfa-Mir-105-P1 Cpo-Mir-105-P1 Ete-Mir-105-P1 Hsa-Mir-105-P1 Mmu-Mir-105-P1 Ocu-Mir-105-P1 Rno-Mir-105-P1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (rheMac8_trace) |
chrX: 146011649-146011707 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-105-P1) |
Mir-105-P2
chrX: 146009457-146009515 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-105-P1 chrX: 146011649-146011707 [-] UCSC Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | GUUGCAGGAUCUUCUGUGUGUGCAUCGUGGUCAAAUGCUCAGACUCCUGUGGUGGCUGCUUAUGCACCACGGAUGUUUGAGCAUGUGCUAUGGUGUCUACUUUUGCAACAUUGCCAUCUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 GUUGCAGGAUCUUCUGU--| U U A UC GCUG GUG GCAUCGUGG CA AUGCUCAGAC CUGUGGUG C CAU UGUGGUAUC GU UACGAGUUUG GGCACCAC U UCUACCGUUACAACGUUUU^ C - G UA GUAU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | UG at 5p(-14), CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Mml-Mir-105-P1_5p |
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mirBase accession | MIMAT0002454 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UCAAAUGCUCAGACUCCUGUGGUG -24
Get sequence
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Proposed targets |
TargetScanVert: mml-miR-105-5p |
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Star sequence | Mml-Mir-105-P1_3p* |
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mirBase accession | MIMAT0026583 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
36- CCACGGAUGUUUGAGCAUGUGCU -59
Get sequence
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Proposed targets |
TargetScanVert: mml-miR-105-3p |