| MirGeneDB ID | Hsa-Mir-148-P4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-148 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | CAGUGCA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Human (Homo sapiens) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | hsa-mir-148b | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Hsa-Mir-148-P1 Hsa-Mir-148-P3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aca-Mir-148-P4 Ami-Mir-148-P4 Bta-Mir-148-P4 Cfa-Mir-148-P4 Cli-Mir-148-P4 Cmi-Mir-148-P4 Cpi-Mir-148-P4 Cpo-Mir-148-P4 Dno-Mir-148-P4 Ebu-Mir-148 Ete-Mir-148-P4 Gga-Mir-148-P4 Gja-Mir-148-P4 Lch-Mir-148-P4 Loc-Mir-148-P4 Mml-Mir-148-P4 Mmu-Mir-148-P4 Mun-Mir-148-P4 Ocu-Mir-148-P4 Pbv-Mir-148-P4 Rno-Mir-148-P4 Sha-Mir-148-P4 Spt-Mir-148-P4 Tgu-Mir-148-P4 Xla-Mir-148-P4a Xla-Mir-148-P4b Xtr-Mir-148-P4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Gnathostomata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Vertebrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (hg38) |
chr12: 54337239-54337299 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UCAUUUCCAAGCACGAUUAGCAUUUGAGGUGAAGUUCUGUUAUACACUCAGGCUGUGGCUCUCUGAAAGUCAGUGCAUCACAGAACUUUGUCUCGAAAGCUUUCUAGCAGCUACCCAUUUUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 60 UCAUUUCCAAGCACGAUU--| A UG U A CA GUGGCU AGC UUUGAGG AAGUUCUGU AU CACU GGCU \ UCG AAGCUCU UUCAAGACA UA GUGA CUGA C UUUUACCCAUCGACGAUCUU^ A GU C C -- AAGUCU . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17), UGUG in loop | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Hsa-Mir-148-P4_5p* |
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| mirBase accession | MIMAT0004699 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- GAAGUUCUGUUAUACACUCAGGCU -24
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0004699 TargetScanVert: hsa-miR-148b-5p TargetMiner: hsa-miR-148b-5p miRDB: MIMAT0004699 |
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| Mature sequence | Hsa-Mir-148-P4_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0000759 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
39- UCAGUGCAUCACAGAACUUUGU -61
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0000759 TargetScanVert: hsa-miR-148b-3p TargetMiner: hsa-miR-148b-3p miRDB: MIMAT0000759 |
