MirGeneDB ID | Dya-Mir-992 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-992 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Fruit fly (Drosophila yakuba) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | dya-mir-992 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Dme-Mir-992 Dsi-Mir-992 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | D. melanogaster subgroup | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | D. melanogaster subgroup | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (Drosophila_yakuba.dyak_caf1.dna.toplevel) |
2R: 12723689-12723744 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-992) |
Mir-7
2R: 12702754-12702815 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-992 2R: 12723689-12723744 [+] UCSC Ensembl Mir-991 2R: 12723801-12723862 [+] UCSC Ensembl Mir-9681 2R: 12724136-12724190 [+] UCSC Ensembl Mir-92-P6a 2R: 12724560-12724622 [+] UCSC Ensembl Mir-92-P7 2R: 12724704-12724764 [+] UCSC Ensembl Mir-92-P6b 2R: 12724839-12724897 [+] UCSC Ensembl Mir-92-P5 2R: 12724949-12725008 [+] UCSC Ensembl |
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Seed | AGUAUCA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GGACUCUUGGAUCUGAUUUUCCCAAGUGCUUAGUAUCAGCAAGGUGUAAUUUUUGUUUGGUUAAAGUACACGUUACUGGUACUACGUACUUCGAGAAACCUAACUACGGAGGAUACGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 GGACUCUUGGAUCUGAU---| CC U C G A UUGU UUUC AAGUGC UAGUAUCAG AA GUGUA UUU U AGAG UUCAUG AUCAUGGUC UU CACAU AAA U CAUAGGAGGCAUCAAUCCAA^ C- C A G G UUGG 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Dya-Mir-992_5p |
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mirBase accession | MIMAT0039164 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UAGUAUCAGCAAGGUGUAAUUU -22
Get sequence
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Star sequence | Dya-Mir-992_3p* |
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mirBase accession | MIMAT0039165 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
34- AGUACACGUUACUGGUACUACG -56
Get sequence
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