MirGeneDB ID | Dme-Mir-992 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-992 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Fruit fly (Drosophila melanogaster) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | dme-mir-992 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Dsi-Mir-992 Dya-Mir-992 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | D. melanogaster subgroup | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | D. melanogaster subgroup | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (Drosophila_melanogaster_BDGP6) |
2R: 20585332-20585390 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-992) |
Mir-92-P5
2R: 20583766-20583825 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-92-P6 2R: 20583888-20583946 [-] UCSC Ensembl Mir-92-P7 2R: 20584058-20584117 [-] UCSC Ensembl Mir-92-P8 2R: 20584194-20584254 [-] UCSC Ensembl Mir-991 2R: 20585214-20585275 [-] UCSC Ensembl Mir-992 2R: 20585332-20585390 [-] UCSC Ensembl Mir-7 2R: 20606081-20606142 [+] UCSC Ensembl |
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Seed | GGUAUCA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
ACAAAUCUAGACAUGAUUUUCCCAAGUGCCUGGUAUCAGCAAAGUGUUAUUUUUUAUGUUUAUGUAAAGUACACGUUUCUGGUACUAAGUACUUCGAGAAAGUUACCUGCGUAGGAUAUGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 ACAAAUCUAGACAUGAU- CC-| C CAAA U UUAUG UUUC AAGUGC UGGUAUCAG GUGU AUUUU U AAAG UUCAUG AUCAUGGUC CACA UGAAA U UAUAGGAUGCGUCCAUUG AGC^ A UUUG - UGUAU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Dme-Mir-992_5p |
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mirBase accession | MIMAT0020891 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UGGUAUCAGCAAAGUGUUAUUUU -23
Get sequence
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Co-mature sequence | Dme-Mir-992_3p |
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mirBase accession | MIMAT0005510 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
37- AGUACACGUUUCUGGUACUAAG -59
Get sequence
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Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0005510 TargetScanFly: dme-miR-992 |