| MirGeneDB ID | Dno-Mir-490 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-490 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | AACCUGG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Nine-banded armadillo (Dasypus novemcinctus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | dno-mir-490 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aca-Mir-490 Ami-Mir-490 Bta-Mir-490 Cfa-Mir-490 Cli-Mir-490 Cpi-Mir-490 Cpo-Mir-490 Ete-Mir-490 Gga-Mir-490 Gja-Mir-490 Hsa-Mir-490 Mdo-Mir-490 Mml-Mir-490 Mmu-Mir-490 Oan-Mir-490 Ocu-Mir-490 Pbv-Mir-490 Rno-Mir-490 Sha-Mir-490 Spt-Mir-490 Tgu-Mir-490 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Amniota | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Amniota | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (dasNov3) |
JH568517: 1207986-1208045 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UUACUGGUUUGAAAAGUUCAUUGUUCGACACCAUGGAUCUCCAGGUGGGUCACGUUUAGAGAUACACCAACCUGGAGGACUCCAUGCUGUUGAGCUGUUCACAAGCAGCGGACACUUCUAGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 UUACUGGUUUGAAAAGUUCAUU--- C --| G CACGUUU GUUCGACA CAUGGA UCUCCAGGU GGU \ CGAGUUGU GUACCU GGAGGUCCA CCA A AUCUUCACAGGCGACGAACACUUGU C CA^ A CAUAGAG . 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Dno-Mir-490_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | MIMAT0047922 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CCAUGGAUCUCCAGGUGGGU -20
Get sequence
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| Mature sequence | Dno-Mir-490_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0047923 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
37- CAACCUGGAGGACUCCAUGCUGU -60
Get sequence
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