| MirGeneDB ID | Dno-Mir-345 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-345 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Nine-banded armadillo (Dasypus novemcinctus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | dno-mir-345 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-345 Cfa-Mir-345 Cja-Mir-345 Cpo-Mir-345 Eca-Mir-345 Ete-Mir-345 Hsa-Mir-345 Laf-Mir-345-P1 Laf-Mir-345-P2 Laf-Mir-345-P3 Mml-Mir-345 Mmr-Mir-345 Mmu-Mir-345-v1 Pab-Mir-345 Rno-Mir-345 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (dasNov3) |
JH562024: 202692-202749 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | CUGACUC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UUCAGGAAGCAGAGACCCAGCCCCAGGUCUGCUGACUCCUAGUCCAGAGCCCGUGGUGGCCGUGGGGCCCUGAACUUGGGGUCUGGAGGCCGGGGUUUGGAUAGCACCUGCCUCUCUGGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 UUCAGGAAGCAGAGACCC---| A G - U C A GUGGU AGCCCC GGUCU CU GACUCC AGU CAG GCCC G UUGGGG CCGGA GG CUGGGG UCA GUC CGGG G GUCUCUCCGUCCACGAUAGGU^ - - U U A C GUGCC 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| Comment | There is a second Dicer cut -1 on both arms. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | Yes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17), UGUG in loop | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Dno-Mir-345_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0047827 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- GCUGACUCCUAGUCCAGAGCCC -22
Get sequence
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| Star sequence | Dno-Mir-345_3p* (predicted) |
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| mirBase accession | MIMAT0047828 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
36- GCCCUGAACUUGGGGUCUGGAG -58
Get sequence
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