| MirGeneDB ID | Dlo-Mir-276 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-276 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Braconid wasp (Diachasmimorpha longicaudata) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aae-Mir-276-P1 Aae-Mir-276-P2 Aga-Mir-276-P1 Aga-Mir-276-P2 Bge-Mir-276 Csc-Mir-276-P10 Csc-Mir-276-P11a Csc-Mir-276-P11b Dan-Mir-276-P1 Dan-Mir-276-P2 Dma-Mir-276 Dme-Mir-276-P1 Dme-Mir-276-P2 Dmo-Mir-276-P1 Dmo-Mir-276-P2 Dpu-Mir-276 Dsi-Mir-276-P1 Dsi-Mir-276-P2 Dya-Mir-276-P1 Dya-Mir-276-P2 Gpa-Mir-276-P1 Gpa-Mir-276-P2 Hme-Mir-276 Isc-Mir-276 Lpo-Mir-276-P3 Lpo-Mir-276-P4 Lpo-Mir-276-P5 Lpo-Mir-276-P6 Lpo-Mir-276-P7 Lpo-Mir-276-P8 Lpo-Mir-276-P9 Tca-Mir-276 Tca-Mir-276-as Tur-Mir-276 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Arthropoda | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Arthropoda | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCF_034640455.1_iyDiaLong2_genomic) |
NC_087234.1: 7920715-7920772 [-] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-276) |
Mir-96-P2
NC_087234.1: 7904077-7904138 [+]
Ensembl
Mir-276 NC_087234.1: 7920715-7920772 [-] Ensembl |
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| Seed | AGGAACU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GGUGUUUUUAUUUUGUCAUGGUUAUUCAGCAGCGAGGUAUAGAGUUCCUACGUUGAUUUCAAAUAGUAGGAACUUCUUACCGUGCUCUUGGACUUGCCUAAAUAUCAUCAUUCCCCGUGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 GGUGUUUUUAUUUUGUCAU- UA-| C A UA GUUGAU GGU UUCAG AGCG GGUA GAGUUCCUAC U CCG AGGUU UCGU CCAU UUCAAGGAUG U UGCCCCUUACUACUAUAAAU UUC^ C G UC AUAAAC 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Dlo-Mir-276_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AGCGAGGUAUAGAGUUCCUACG -22
Get sequence
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| Mature sequence | Dlo-Mir-276_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
36- UAGGAACUUCUUACCGUGCUCU -58
Get sequence
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