| MirGeneDB ID | Dpu-Mir-276 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-276 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Common water flea (Daphnia pulex) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | dpu-mir-276 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aae-Mir-276-P1 Aae-Mir-276-P2 Aga-Mir-276-P1 Aga-Mir-276-P2 Bge-Mir-276 Csc-Mir-276-P10 Csc-Mir-276-P11a Csc-Mir-276-P11b Dan-Mir-276-P1 Dan-Mir-276-P2 Dlo-Mir-276 Dma-Mir-276 Dme-Mir-276-P1 Dme-Mir-276-P2 Dmo-Mir-276-P1 Dmo-Mir-276-P2 Dsi-Mir-276-P1 Dsi-Mir-276-P2 Dya-Mir-276-P1 Dya-Mir-276-P2 Gpa-Mir-276-P1 Gpa-Mir-276-P2 Hme-Mir-276 Isc-Mir-276 Lpo-Mir-276-P3 Lpo-Mir-276-P4 Lpo-Mir-276-P5 Lpo-Mir-276-P6 Lpo-Mir-276-P7 Lpo-Mir-276-P8 Lpo-Mir-276-P9 Tca-Mir-276 Tca-Mir-276-as Tur-Mir-276 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Arthropoda | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Arthropoda | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Daphnia_pulex.V1.0) |
DAPPUscaffold_15: 755618-755688 [+] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | AGGAACU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
AUCGUCGUCGAAUGGAUGUGACGUGUCGCUAGCGAGGUAUAGAGUUCCUACGUCUUGUCACUGAAUUCAAGUCGAUUGGUAGGAACUUCAUACCGUGCUCUCGACGCCAAUCCGAUAGUCUCCGAUUCAUCGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 AUCGUCGUCGAAUGGAUGUGAC--| CU A AG GUCUUGUCACUGA GUGUCG AGCG GGUAU AGUUCCUAC \ CGCAGC UCGU CCAUA UCAAGGAUG A CUACUUAGCCUCUGAUAGCCUAAC^ UC G CU GUUAGCUGAACUU . 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UG at 5p(-14) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Dpu-Mir-276_5p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AGCGAGGUAUAGAGUUCCUACG -22
Get sequence
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| Mature sequence | Dpu-Mir-276_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0012652 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
49- UAGGAACUUCAUACCGUGCUCU -71
Get sequence
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