MirGeneDB ID | Dya-Mir-276-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Family name | MIR-276 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Fruit fly (Drosophila yakuba) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | dya-mir-276a | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Dya-Mir-276-P1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aae-Mir-276-P2 Aga-Mir-276-P2 Bge-Mir-276 Dan-Mir-276-P2 Dlo-Mir-276 Dma-Mir-276 Dme-Mir-276-P2 Dmo-Mir-276-P2 Dpu-Mir-276 Dsi-Mir-276-P2 Gpa-Mir-276-P2 Hme-Mir-276 Isc-Mir-276 Tca-Mir-276 Tur-Mir-276 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Diptera | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Arthropoda | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (Drosophila_yakuba.dyak_caf1.dna.toplevel) |
3L: 10348902-10348960 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-276-P2) |
Mir-276-P1
3L: 10302168-10302225 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-276-P2 3L: 10348902-10348960 [+] UCSC Ensembl |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | AGGAACU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CAAGAUAUUUUUUACCUGGUUUUUGCCAUCAGCGAGGUAUAGAGUUCCUACGUUCAUUAUAAACUCGUAGGAACUUCAUACCGUGCUCUUGGAAGACCAAAAAACAACCAAGUGAAUGCGet precursor sequence |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 CAAGAUAUUUUUUACCU----| UG UC A AG UUCAUU GGUUUU CCA AGCG GGUAU AGUUCCUACG \ CCAGAA GGU UCGU CCAUA UCAAGGAUGC A CGUAAGUGAACCAACAAAAAA^ -- UC G CU UCAAAU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | UG at 5p(-14), CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Star sequence | Dya-Mir-276-P2_5p* |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- AGCGAGGUAUAGAGUUCCUACG -22
Get sequence
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mature sequence | Dya-Mir-276-P2_3p |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mirBase accession | MIMAT0009117 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
37- UAGGAACUUCAUACCGUGCUCU -59
Get sequence
|