| MirGeneDB ID | Dan-Mir-282 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-282 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Fruit fly (Drosophila ananassae) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | dan-mir-282 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aae-Mir-282-P1 Aae-Mir-282-P2 Aga-Mir-282 Bge-Mir-282 Dma-Mir-282-v1 Dme-Mir-282 Dmo-Mir-282 Dpu-Mir-282 Dsi-Mir-282 Dya-Mir-282 Gpa-Mir-282 Hme-Mir-282 Tca-Mir-282 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Pancrustacea | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Pancrustacea | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Dana_caf1) |
scaffold_13337: 7556623-7556687 [+] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-282) |
Mir-282
scaffold_13337: 7556623-7556687 [+]
Ensembl
Mir-955 scaffold_13337: 7606454-7606515 [+] Ensembl |
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| Seed | AGCCUCU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
AUUCGAAAAUCGAAAAUUUCCUUAUAGAUCUAGCCUCUACUAGGCUUUGUCUGUGCAUUCGAAAGUCGAUCAGACAUAGCCUAUAAGAGGUUAGGUGUACCAAGGCGACAAGACAUCACAAAAACGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 AUUCGAAAAUCGAAAAUUU- A-| G AC U GUGCAUUCG CCUU UA AUCUAGCCUCU UAGGCU UGUCU \ GGAA AU UGGAUUGGAGA AUCCGA ACAGA A CAAAAACACUACAGAACAGC CC^ G AU U CUAGCUGAA 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UGUG in loop | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Dan-Mir-282_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0008445 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UAGCCUCUACUAGGCUUUGUCU -22
Get sequence
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| Star sequence | Dan-Mir-282_3p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
43- ACAUAGCCUAUAAGAGGUUAGG -65
Get sequence
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