| MirGeneDB ID | Aga-Mir-282 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-282 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | African malaria mosquito (Anopheles gambiae) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | aga-mir-282 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aae-Mir-282-P1 Aae-Mir-282-P2 Bge-Mir-282 Dan-Mir-282 Dma-Mir-282-v1 Dme-Mir-282 Dmo-Mir-282 Dpu-Mir-282 Dsi-Mir-282 Dya-Mir-282 Gpa-Mir-282 Hme-Mir-282 Tca-Mir-282 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Pancrustacea | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Pancrustacea | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCF_943734735.2_idAnoGambNW_F1_1_genomic) |
NC_064601.1: 86381191-86381254 [-] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | AGCCUCU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
AUGCCCAACACACCAAUAACAGAGCUAAUCUAGCCUCUUCUAGGCUUUGUCUGUACAGUUUCUGCAAACCAGACAUAGCCUGUCAGAGGUUAGGUGAAAUCUGCUAGUACAACGGUGUGGUGUGGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 AUGCCCAACACACCAAUAA--| GCUA UC U GUACAGUU CAGA AUCUAGCCUCU UAGGCU UGUCU U GUCU UGGAUUGGAGA GUCCGA ACAGA C GUGUGGUGUGGCAACAUGAUC^ AAAG CU U CCAAACGU 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Aga-Mir-282_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0001514 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UAGCCUCUUCUAGGCUUUGUCU -22
Get sequence
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| Star sequence | Aga-Mir-282_3p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
42- ACAUAGCCUGUCAGAGGUUAGG -64
Get sequence
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