| MirGeneDB ID | Csc-Mir-193-P2v | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-193 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Arizona bark scorpion (Centruroides sculpturatus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Csc-Mir-193-P1u | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bge-Mir-193-P2 Cbr-Mir-193-P2-v1 Cel-Mir-193-P2-v1 Cte-Mir-193-P2 Dgr-Mir-193-P2 Dlo-Mir-193-P2 Ebu-Mir-193-P2 Hme-Mir-193-P2 Hru-Mir-193-P2 Lgi-Mir-193-P2 Llo-Mir-193-P2-v1 Mgi-Mir-193-P2 Pau-Mir-193-P2 Pdu-Mir-193-P2 Pfl-Mir-193-P2 Pma-Mir-193-P2 Pmi-Mir-193-P2 Pve-Mir-193-P2 Rph-Mir-193-P2 Sko-Mir-193-P2 Snu-Mir-193-P2 Spu-Mir-193-P2 Sro-Mir-193-P2 Tca-Mir-193-P2 Xbo-Mir-193-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | C. sculpturatus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCF_000671375.1_CSC) |
NW_019387724.1: 416-476 [+] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | AAUGCCC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UAUCACCUUUUAUGGGAGCUGAAGCAGAAAUGGGGUUUCUAAUCGGCAUUUACCAUGACAAAUUUUAUGCAAUGCCCUUGGAAAUCCCAAAUAUGCUCAGCAAUUUCGUCGACCGAAUCUCGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 UAUCACCUUUUAUGGGA---| A GAAA UC UACCAUGAC GCUGA GCA UGGGGUUUCUAA GGCAUU A CGACU CGU ACCCUAAAGGUU CCGUAA A CUCUAAGCCAGCUGCUUUAA^ - AUAA C- CGUAUUUUA . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Csc-Mir-193-P2v_5p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UGGGGUUUCUAAUCGGCAUUUAC -23
Get sequence
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| Mature sequence | Csc-Mir-193-P2v_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
39- CAAUGCCCUUGGAAAUCCCAAA -61
Get sequence
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