| MirGeneDB ID | Csc-Mir-153-P19b | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-153 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Arizona bark scorpion (Centruroides sculpturatus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Csc-Mir-153-P18 Csc-Mir-153-P19a-v1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Agr-Mir-153 Asu-Mir-153 Bfl-Mir-153 Bko-Mir-153 Bla-Mir-153 Bpl-Mir-153 Cin-Mir-153 Cte-Mir-153 Dgr-Mir-153 Dma-Mir-153 Dpu-Mir-153 Eba-Mir-153 Egr-Mir-153 Gsa-Mir-153 Gsp-Mir-153 Hmi-Mir-153 Hru-Mir-153 Isc-Mir-153 Lan-Mir-153 Lgi-Mir-153 Llo-Mir-153 Mgi-Mir-153 Mom-Mir-153 Npo-Mir-153 Obi-Mir-153 Ofu-Mir-153 Ovu-Mir-153 Pau-Mir-153 Pca-Mir-153 Pcr-Mir-153 Pdu-Mir-153 Pfl-Mir-153 Pmi-Mir-153 Pve-Mir-153 Rph-Mir-153 Sko-Mir-153 Sme-Mir-153 Snu-Mir-153 Spu-Mir-153 Tur-Mir-153 War-Mir-153 Xbo-Mir-153 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | C. sculpturatus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCF_000671375.1_CSC) |
NW_019385909.1: 125554-125611 [+] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-153-P19b-v1) |
Mir-153-P19a-v2
NW_019385909.1: 125022-125081 [+]
Ensembl
Mir-153-P19a-v1 NW_019385909.1: 125023-125080 [+] Ensembl Mir-153-P19b-v2 NW_019385909.1: 125553-125612 [+] Ensembl Mir-153-P19b-v1 NW_019385909.1: 125554-125611 [+] Ensembl |
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| Variant | Csc-Mir-153-P19b-v1 |
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| Seed | CAUUUUU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GAAAAAAAGGCAUUUACCUAAUCAUACUUAUCAUUUUUGUGAUUGGUGCAAUUGUAUUUCAACAAGUUGCAUAGUCAUAAAAAUGAUGGGUGUGUUCUGGUUUAUCAUCUAGAUCAUCGet precursor sequence |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 GAAAAAAAGGCAUUUAC- AU-| G GUAUU CUA CAUACUUAUCAUUUUUGUGAUUG UGCAAUU \ GGU GUGUGGGUAGUAAAAAUACUGAU ACGUUGA U CUACUAGAUCUACUAUUU CUU^ - ACAAC 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Csc-Mir-153-P19b-v1_5p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UCAUUUUUGUGAUUGGUGCAAUU -23
Get sequence
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| Star sequence | Csc-Mir-153-P19b-v1_3p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
36- UUGCAUAGUCAUAAAAAUGAUG -58
Get sequence
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| Variant | Csc-Mir-153-P19b-v2 |
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| Seed | UCAUUUU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UGAAAAAAAGGCAUUUACCUAAUCAUACUUAUCAUUUUUGUGAUUGGUGCAAUUGUAUUUCAACAAGUUGCAUAGUCAUAAAAAUGAUGGGUGUGUUCUGGUUUAUCAUCUAGAUCAUCAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 UGAAAAAAAGGCAUUUA--| UAAU G GUAUU CC CAUACUUAUCAUUUUUGUGAUUG UGCAAUU \ GG GUGUGGGUAGUAAAAAUACUGAU ACGUUGA U ACUACUAGAUCUACUAUUU^ UCUU - ACAAC . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Csc-Mir-153-P19b-v2_5p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AUCAUUUUUGUGAUUGGUGCAAUU -24
Get sequence
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| Star sequence | Csc-Mir-153-P19b-v2_3p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
37- UUGCAUAGUCAUAAAAAUGAUGG -60
Get sequence
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