| MirGeneDB ID | Cli-Mir-737 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-737 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Rock pigeon (Columba livia) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | cli-mir-737 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aca-Mir-737 Ami-Mir-737 Cpi-Mir-737 Dre-Mir-737 Gja-Mir-737 Gmo-Mir-737 Lch-Mir-737 Loc-Mir-737 Mal-Mir-737 Mun-Mir-737 Oan-Mir-737 Pbv-Mir-737 Spt-Mir-737 Tni-Mir-737 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Osteichthyes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Osteichthyes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (colLiv2) |
scaffold244: 3380836-3380896 [-] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UUUUUUU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UGGUUUUCUUGUUUGGUUGGUUUGGGUUGAGUUUUUUUAGGUUUUGAUUUUUAUUACAUCUUUGUACAAAAAUCAAAACGUAAAGAAAAUGCUGCAAAGAUAGAUUGUUCUGCUCUUGGAUGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 UGGUUUUCUUGUUUGGUUGG--- -| UGAG G AUUACAU UUUG GGU UUUUUUUA GUUUUGAUUUUU \ AAAC UCG AAAGAAAU CAAAACUAAAAA C UAGGUUCUCGUCUUGUUAGAUAG G^ UA-- G CAUGUUU . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Cli-Mir-737_5p (predicted) |
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| mirBase accession | MIMAT0038667 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- GUUUUUUUAGGUUUUGAUUUUU -22
Get sequence
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| Star sequence | Cli-Mir-737_3p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
39- AAAUCAAAACGUAAAGAAAAUG -61
Get sequence
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