| MirGeneDB ID | Mal-Mir-737 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-737 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Asian swamp eel (Monopterus albus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aca-Mir-737 Ami-Mir-737 Cli-Mir-737 Cpi-Mir-737 Dre-Mir-737 Gja-Mir-737 Gmo-Mir-737 Lch-Mir-737 Loc-Mir-737 Mun-Mir-737 Oan-Mir-737 Pbv-Mir-737 Spt-Mir-737 Tni-Mir-737 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Osteichthyes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Osteichthyes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_001952655.1_M_albus_1.0_genomic) |
KV884956.1: 145429-145489 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UUUUUUU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CCACCGCCGCCGCAGCUCUGCUGCUCUGUUGUUUUUUUAGGUUUUGAUUUUUUGUAGCAUUGGAUGAGAAAAUCAAAGCCUAAAGAAAAUACAGCGCUGACAGGAGACAAGCCCUUGAGUUGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 CCACCGCCGCCGCAGCU- CU-| U UG UGUAGCA CUG GC CUGU UUUUUUUAGGUUUUGAUUUUU \ GAC CG GACA AAAGAAAUCCGAAACUAAAAG U UUGAGUUCCCGAACAGAG AGU^ C UA AGUAGGU . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| Comment | There is a second Dicer cut -1 on both arms. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UGUG in loop | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Mal-Mir-737_5p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- GUUUUUUUAGGUUUUGAUUUUU -22
Get sequence
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| Star sequence | Mal-Mir-737_3p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
39- AAAUCAAAGCCUAAAGAAAAUA -61
Get sequence
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