MirGeneDB ID | Bta-Mir-430-P7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-430 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Cow (Bos taurus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Bta-Mir-430-P1 Bta-Mir-430-P2 Bta-Mir-430-P3 Bta-Mir-430-P4 Bta-Mir-430-P5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Cfa-Mir-430-P7d1 Cfa-Mir-430-P7d2 Cja-Mir-430-P7 Eca-Mir-430-P7 Hsa-Mir-430-P7 Laf-Mir-430-P7 Mml-Mir-430-P7 Mmr-Mir-430-P7 Mmu-Mir-430-P7a Mmu-Mir-430-P7b Mmu-Mir-430-P7c Pab-Mir-430-P7 Rno-Mir-430-P7a Rno-Mir-430-P7b Rno-Mir-430-P7c Xla-Mir-430-o7a Xla-Mir-430-o7b Xtr-Mir-430-o7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Vertebrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCF_002263795.1_ARS-UCD1.2_BTA) |
NC_037345.1: 60903424-60903481 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-430-P7) |
Mir-430-P5
NC_037345.1: 60903182-60903240 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-430-P7 NC_037345.1: 60903424-60903481 [+] UCSC Ensembl |
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Seed | AAGUGCU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
AGAACUGGUUCCAGUAACCCAGACCGGGAUGCUCAAAAUGGGGGUGCUUGCCGAUUUGUGACUGGAAAGUGCUCCCAUUUUCGAGCGUCCCUGCUCGGGGAAACCAUCUAAGGAUUGGGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 AGAACUGGUUCCAGUAA- A C - -| UG G GAUUU CCC GA C GGGAUGCUC AAAAUGGGGG CUU CC \ GGG CU G CCCUGCGAG UUUUACCCUC GAA GG G GGUUAGGAAUCUACCAAA G C U C^ GU A UCAGU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Bta-Mir-430-P7_5p* (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- GCUCAAAAUGGGGGUGCUUGCC -22
Get sequence
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Mature sequence | Bta-Mir-430-P7_3p (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
35- AAAGUGCUCCCAUUUUCGAGCGU -58
Get sequence
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