| MirGeneDB ID | Aca-Mir-147-v2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-147 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | GUGUGCG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Green anole lizard (Anolis carolinensis) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | aca-mir-147 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Aca-Mir-147-v1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Ami-Mir-147-v2 Bta-Mir-147 Cli-Mir-147 Cmi-Mir-147 Cpi-Mir-147-v2 Cpo-Mir-147-v2 Dno-Mir-147-v2 Gga-Mir-147 Hsa-Mir-147-v2 Lch-Mir-147 Loc-Mir-147-v2 Mal-Mir-147-v2 Mdo-Mir-147 Mml-Mir-147 Mmu-Mir-147-v2 Oan-Mir-147 Ocu-Mir-147 Pbv-Mir-147-v2 Pma-Mir-147 Rno-Mir-147-v2 Spt-Mir-147 Tgu-Mir-147 Tni-Mir-147 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Vertebrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Vertebrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (anoCar2) |
GL343506.1: 18029-18086 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-147-v2) |
Mir-147-v1
GL343506.1: 18028-18087 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-147-v2 GL343506.1: 18029-18086 [-] UCSC Ensembl |
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| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | GCCUCUUCACGUGACACUCUAUGAAUCUAGUGGAAUCACUUCCGCACAAACUAGAUGAAUGAAACCAGUGUGCGGAAAUGCUUCUGCUACAUUUUUAGGGUCUCCCUCCAGCUUUUUGGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 GCCUCUUCACGUGACAC--| U C UG U C AACUAGAUG UCUA GAAU UAG GAA CA UUCCGCACA A GGAU UUUA AUC CUU GU AAGGCGUGU A GUUUUUCGACCUCCCUCUG^ U C GU C A GACCAAAGU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Aca-Mir-147-v2_5p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UGGAAUCACUUCCGCACAAACU -22
Get sequence
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| Mature sequence | Aca-Mir-147-v2_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0021779 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
36- AGUGUGCGGAAAUGCUUCUGCU -58
Get sequence
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