Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MirGeneDB ID ▲ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Em | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Xla-Mir-19-P1a3 | xla-mir-19a | MIR-19 | GUUUUGC | MIMAT0046512 | MIMAT0046513 | NC_030726.1 | 122721555 | 122721612 | - | X. laevis | Vertebrata | No | 1 | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Xla-Mir-19-P1a4 | None | MIR-19 | GUUUUGC | None | None | NC_030727.1 | 104999128 | 104999185 | - | X. laevis | Vertebrata | No | 1 | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Xla-Mir-19-P2a3 | None | MIR-19 | GUGCAAA | None | None | NC_030726.1 | 122721259 | 122721320 | - | X. laevis | Vertebrata | No | 1 | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Xla-Mir-19-P2a4 | xla-mir-19b-2 | MIR-19 | GUGCAAA | MIMAT0046514 | MIMAT0046515 | NC_030727.1 | 104998831 | 104998891 | - | X. laevis | Vertebrata | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Xla-Mir-19-P2c3 | xla-mir-19b | MIR-19 | GUGCAAA | None | MIMAT0001347 | NC_030738.1 | 47238435 | 47238491 | - | X. laevis | Vertebrata | No | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Xla-Mir-19-P2c4 | None | MIR-19 | GUGCAAA | None | None | NC_030739.1 | 74792343 | 74792399 | - | X. laevis | Vertebrata | No | 1 |
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all