Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MirGeneDB ID ▲ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Bo | Br | He | Ki | Li | Ly | Pa | Sk | Sp | Te | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sha-Mir-9-P1 | None | MIR-9 | CUUUGGU | None | None | GL834472.1 | 1703520 | 1703581 | - | Gnathostomata | Bilateria | No | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sha-Mir-9-P2 | sha-mir-9 | MIR-9 | CUUUGGU | MIMAT0022783 | None | GL841279.1 | 926547 | 926606 | + | Gnathostomata | Bilateria | No | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sha-Mir-9-P3 | None | MIR-9 | CUUUGGU | None | None | GL856822.1 | 1577136 | 1577197 | - | Gnathostomata | Bilateria | No | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sha-Mir-9-P4 | None | MIR-9 | CUUUGGU | None | None | GL841420.1 | 1045007 | 1045065 | - | Gnathostomata | Bilateria | No | 1 | 1 |
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all