Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MirGeneDB ID ▲ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Fe | Fe | In | Ma | Ma | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mal-Mir-27-P1 | None | MIR-27 | UCACAGU | None | None | KV884702.1 | 3701989 | 3702051 | + | Gnathostomata | Vertebrata | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mal-Mir-27-P2a | None | MIR-27 | UCACAGU | None | None | KV884846.1 | 922849 | 922910 | + | Clupeocephala | Vertebrata | No | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mal-Mir-27-P2b | None | MIR-27 | UCACAGU | None | None | KV884708.1 | 577864 | 577926 | + | Clupeocephala | Vertebrata | No | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mal-Mir-27-P3 | None | MIR-27 | UCACAGU | None | None | KV884862.1 | 448987 | 449048 | + | Gnathostomata | Vertebrata | No | 1 | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mal-Mir-27-P4a | None | MIR-27 | UCACAGU | None | None | KV884817.1 | 552481 | 552544 | - | Clupeocephala | Vertebrata | No | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mal-Mir-27-P4b | None | MIR-27 | UCACAGU | None | None | KV884702.1 | 2269816 | 2269878 | + | Clupeocephala | Vertebrata | No |
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all