| MirGeneDB ID | Tgu-Mir-1416 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-1416 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Zebra finch (Taeniopygia guttata) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Ami-Mir-1416 Cli-Mir-1416 Cpi-Mir-1416 Gga-Mir-1416 Oan-Mir-1416 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Amniota | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Amniota | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (TaeGut1_add) |
Z: 12198647-12198705 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | CCUUAAC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CGUCUCAUGAAAAGCAGGGUUGAUCCUCUUUCCUUAACUCAUGCCACUGUGCCUUUUUAUUUACUUCACCAUUGUGUGAGUUGAGUACAGAGUGUCUUUCCAACCCUGCGUCACCCCCUGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 CGUCUCAUGAAAAGCAG- UU-| UC UUC CACU CCUUUUU GG GA CUCU CUUAACUCAUGC GUG \ CC CU GAGA GAGUUGAGUGUG CAC A UCCCCCACUGCGUCCCAA UUU^ GU CAU UUAC UUCAUUU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Tgu-Mir-1416_5p (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UCCUUAACUCAUGCCACUGUGC -22
Get sequence
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| Star sequence | Tgu-Mir-1416_3p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
37- ACCAUUGUGUGAGUUGAGUACA -59
Get sequence
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