| MirGeneDB ID | Tca-Mir-137 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-137 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Red flour beetle (Tribolium castaneum) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | tca-mir-137 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Tca-Mir-137-v1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aga-Mir-137 Agr-Mir-137 Asu-Mir-137 Ava-Mir-137 Bfl-Mir-137 Bko-Mir-137 Bpl-Mir-137 Cbr-Mir-137 Cel-Mir-137 Cte-Mir-137 Dan-Mir-137 Dgr-Mir-137 Dma-Mir-137 Dme-Mir-137 Dmo-Mir-137 Dpu-Mir-137 Dsi-Mir-137 Dya-Mir-137 Eba-Mir-137 Ebu-Mir-137 Esc-Mir-137 Gpa-Mir-137 Hme-Mir-137 Hru-Mir-137 Isc-Mir-137 Lan-Mir-137 Lgi-Mir-137 Lhy-Mir-137 Llo-Mir-137 Mgi-Mir-137 Mom-Mir-137 Obi-Mir-137 Ofu-Mir-137 Pau-Mir-137 Pca-Mir-137 Pdu-Mir-137 Pve-Mir-137 Rph-Mir-137 Sko-Mir-137 Snu-Mir-137 Spu-Mir-137 Tur-Mir-137 War-Mir-137 Xbo-Mir-137 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Tcas5.2) |
LG7: 3734620-3734680 [+] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-137-v2) |
Mir-137-v1
LG7: 3734620-3734680 [+]
Ensembl
Mir-137-v2 LG7: 3734620-3734680 [+] Ensembl |
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| Variant | Tca-Mir-137-v2 |
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| Seed | AUUGCUU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
ACACACGAGGAAAUGGUAACUUGGUUGGUCACGUGUAUUCUUGGGUAAUUAACACAUAUUCAGGGAUGUUAUUGCUUGAGAAUACACGUAGCUGACAAGUGACAACAGCAUCGACAGCGCUGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 ACACACGAGGAAAUGGUA---| G UG UC UG U ACAUAU ACUUG U G ACGUGUAUUCU GGUAAU AAC U UGAAC A C UGCACAUAAGA UCGUUA UUG C UCGCGACAGCUACGACAACAG^ - GU GA GU - UAGGGA . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Tca-Mir-137-v2_5p* |
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| mirBase accession | MIMAT0019117 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- ACGUGUAUUCUUGGGUAAUUAAC -23
Get sequence
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| Mature sequence | Tca-Mir-137-v2_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0008373 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
39- UAUUGCUUGAGAAUACACGUAG -61
Get sequence
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| Variant | Tca-Mir-137-v1 |
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| Seed | UAUUGCU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
ACACACGAGGAAAUGGUAACUUGGUUGGUCACGUGUAUUCUUGGGUAAUUAACACAUAUUCAGGGAUGUUAUUGCUUGAGAAUACACGUAGCUGACAAGUGACAACAGCAUCGACAGCGCUGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 ACACACGAGGAAAUGGUA---| G UG UC UG UAACACAUAU ACUUG U G ACGUGUAUUCU GGUAAU \ UGAAC A C UGCACAUAAGA UCGUUA U UCGCGACAGCUACGACAACAG^ - GU GA GU UUGUAGGGAC . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Tca-Mir-137-v1_5p* |
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| mirBase accession | MIMAT0019117 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- ACGUGUAUUCUUGGGUAAUUAA -22
Get sequence
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| Mature sequence | Tca-Mir-137-v1_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0008373 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
38- UUAUUGCUUGAGAAUACACGUAG -61
Get sequence
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