MirGeneDB ID | Sha-Mir-7262-P7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-7262 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Tasmanian devil (Sarcophilus harrisii) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Sha-Mir-7262-P1 Sha-Mir-7262-P2 Sha-Mir-7262-P3 Sha-Mir-7262-P4 Sha-Mir-7262-P5 Sha-Mir-7262-P6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Mdo-Mir-7262-P7 Neu-Mir-7262-P7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Marsupialia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Marsupialia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (DEVIL_add) |
GL864869.1: 2173450-2173508 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | AACUGCU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CCACAGUCAUUUUUUGAAUGCAGGGUGUCUCAAAAGUUUUAGUGUAGUUUUAAGUUUAUUAAAGCUUAAACUGCUCUAAGACCUUUGGGACACUCUGUAUACUCCCUCCAUCCCAACAUGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 CCACAGUCAUUUUUUGA--| A U UAAGUUUA AUGCAGGGUGUCUCAAA GUUUUAG GUAGUUU \ UAUGUCUCACAGGGUUU CAGAAUC CGUCAAA U UACAACCCUACCUCCCUCA^ C U UUCGAAAU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Sha-Mir-7262-P7_5p* (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- CAAAAGUUUUAGUGUAGUUUUA -22
Get sequence
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Mature sequence | Sha-Mir-7262-P7_3p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
37- AAACUGCUCUAAGACCUUUGGG -59
Get sequence
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