MirGeneDB ID | Sha-Mir-7262-P6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-7262 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Tasmanian devil (Sarcophilus harrisii) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Sha-Mir-7262-P1 Sha-Mir-7262-P2 Sha-Mir-7262-P3 Sha-Mir-7262-P4 Sha-Mir-7262-P5 Sha-Mir-7262-P7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Mdo-Mir-7262-P6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Marsupialia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Marsupialia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (DEVIL_add) |
GL861558.1: 240943-240997 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | AAAACCG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
AGGGCAAAGUCUUAUAUACAGGAUGUCCCAAAAGUCUUAAUGCAGGUUUAAGGUUUUAAAGUUUAAAACCGCACUAAGACUUUUGGAAUACCUUGUAUUUGAAAUGUUAAUAUAAGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 AGGGCAAAGUCUUAUAU--| A C A A A UUU ACAGG UGU CCAAAAGUCUUA UGC GGUUU AGG U UGUUC AUA GGUUUUCAGAAU ACG CCAAA UUU A AAUAUAAUUGUAAAGUUUA^ C A C - A GAA 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Sha-Mir-7262-P6_5p* (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- AAAGUCUUAAUGCAGGUUUAAGG -23
Get sequence
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Mature sequence | Sha-Mir-7262-P6_3p (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
33- UAAAACCGCACUAAGACUUUUG -55
Get sequence
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