| MirGeneDB ID | Pfl-Mir-137 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-137 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Ptychodera (Ptychodera flava) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Pfl-Mir-137-v1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aga-Mir-137 Agr-Mir-137 Asu-Mir-137 Ava-Mir-137 Bfl-Mir-137 Bko-Mir-137 Bpl-Mir-137 Cbr-Mir-137 Cel-Mir-137 Cte-Mir-137 Dan-Mir-137 Dgr-Mir-137 Dma-Mir-137 Dme-Mir-137 Dmo-Mir-137 Dpu-Mir-137 Dsi-Mir-137 Dya-Mir-137 Eba-Mir-137 Ebu-Mir-137 Esc-Mir-137 Gpa-Mir-137 Hme-Mir-137 Hru-Mir-137 Isc-Mir-137 Lan-Mir-137 Lgi-Mir-137 Lhy-Mir-137 Llo-Mir-137 Mgi-Mir-137 Mom-Mir-137 Obi-Mir-137 Ofu-Mir-137 Pau-Mir-137 Pca-Mir-137 Pdu-Mir-137 Pve-Mir-137 Rph-Mir-137 Sko-Mir-137 Snu-Mir-137 Spu-Mir-137 Tur-Mir-137 War-Mir-137 Xbo-Mir-137 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Pfl) |
LD343696.1: 352495-352552 [-] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-137-v2) |
Mir-137-v1
LD343696.1: 352495-352552 [-]
Mir-137-v2 LD343696.1: 352495-352552 [-] |
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| Variant | Pfl-Mir-137-v2 |
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| Seed | UAUUGCU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CGGACAGAGCAGGCUAUGCACGUGUCAGUCACGCGUAUUCUCGGGUUGAUAAUACAUUCGUGAUGUUAUUGCUUGAGAAUACACGUAGCUCACUCGAUGCUCGAAACAACUCGGCACGGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 CGGACAGAGCAGGCUAU- -| U C UC C U CAUU GCA CG GU AG ACG GUAUUCUCGGGU GAUAAUA \ CGU GC CA UC UGC CAUAAGAGUUCG UUAUUGU C GCACGGCUCAACAAAGCU A^ U C GA A - AGUG 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UG at 5p(-14) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Pfl-Mir-137-v2_5p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- ACGCGUAUUCUCGGGUUGAUAAUA -24
Get sequence
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| Mature sequence | Pfl-Mir-137-v2_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
35- UUAUUGCUUGAGAAUACACGUAG -58
Get sequence
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| Variant | Pfl-Mir-137-v1 |
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| Seed | AUUGCUU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CGGACAGAGCAGGCUAUGCACGUGUCAGUCACGCGUAUUCUCGGGUUGAUAAUACAUUCGUGAUGUUAUUGCUUGAGAAUACACGUAGCUCACUCGAUGCUCGAAACAACUCGGCACGGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 CGGACAGAGCAGGCUAU- -| U C UC C U ACAUU GCA CG GU AG ACG GUAUUCUCGGGU GAUAAU \ CGU GC CA UC UGC CAUAAGAGUUCG UUAUUG C GCACGGCUCAACAAAGCU A^ U C GA A - UAGUG 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UG at 5p(-14) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Pfl-Mir-137-v1_5p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- ACGCGUAUUCUCGGGUUGAUAAU -23
Get sequence
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| Mature sequence | Pfl-Mir-137-v1_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
36- UAUUGCUUGAGAAUACACGUAG -58
Get sequence
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