| MirGeneDB ID | Ocu-Mir-6715 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-6715 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Rabbit (Oryctolagus cuniculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-6715 Cfa-Mir-6715 Cja-Mir-6715 Cpo-Mir-6715 Eca-Mir-6715 Ete-Mir-6715 Hsa-Mir-6715 Laf-Mir-6715 Mml-Mir-6715 Mmr-Mir-6715 Mmu-Mir-6715 Pab-Mir-6715 Rno-Mir-6715 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (oryCun2_add) |
chr18: 59957230-59957286 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | CAGGCAC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UCCCAAUGCCUGACGCUCUGGGCUGCGUCCACAGGCACGGCCGGUUUGAGCAUUUUGACUGAAUUGCCAAACCAGGUGUGCCUGUGGGCACAACCUUCGCCUGCUCCUCGAAUCUUCGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 UCCCAAUGCCUGACGCUCU--| C C G - A UUUUG GGG UG GUCCACAGGCACG CC GGUUUG GCA A UCC AC CGGGUGUCCGUGU GG CCAAAC CGU C CUUCUAAGCUCCUCGUCCGCU^ A A - A - UAAGU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Ocu-Mir-6715_5p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- ACAGGCACGGCCGGUUUGAGCA -22
Get sequence
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| Star sequence | Ocu-Mir-6715_3p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
36- CCAAACCAGGUGUGCCUGUGG -57
Get sequence
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