MirGeneDB ID | Cpo-Mir-6715 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-6715 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Guinea pig (Cavia porcellus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Bta-Mir-6715 Cfa-Mir-6715 Cja-Mir-6715 Eca-Mir-6715 Ete-Mir-6715 Hsa-Mir-6715 Laf-Mir-6715 Mml-Mir-6715 Mmr-Mir-6715 Mmu-Mir-6715 Ocu-Mir-6715 Pab-Mir-6715 Rno-Mir-6715 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (cavPor3) |
scaffold_11: 3327782-3327838 [-] UCSC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | CAAACCA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UUCCGUGGUUGCCUGCACUGGGCUGUGUUCACAGGCACGGCCGGUUUGAGCAUUUUCACUGAAUUGCCAAACCAGGCGUGCCUGUGGCCACAACUCUCACCUGCGCCCGCCGAGUCUGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 UUCCGUGGUUGCCUGCACU--| C UU G - A UUUUC GGG UGUG CACAGGCACG CC GGUUUG GCA A CUC ACAC GUGUCCGUGC GG CCAAAC CGU C UCUGAGCCGCCCGCGUCCACU^ A CG - A - UAAGU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Cpo-Mir-6715_5p* (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- ACAGGCACGGCCGGUUUGAGCA -22
Get sequence
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Mature sequence | Cpo-Mir-6715_3p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
36- CCAAACCAGGCGUGCCUGUGG -57
Get sequence
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