MirGeneDB ID | Ete-Mir-6715 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-6715 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Lesser hedgehog tenrec (Echinops telfairi) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Bta-Mir-6715 Cfa-Mir-6715 Cja-Mir-6715 Cpo-Mir-6715 Eca-Mir-6715 Hsa-Mir-6715 Laf-Mir-6715 Mml-Mir-6715 Mmr-Mir-6715 Mmu-Mir-6715 Ocu-Mir-6715 Pab-Mir-6715 Rno-Mir-6715 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (echTel2) |
JH980301: 17007898-17007954 [-] UCSC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | CAGGCAC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
AUGGUUUGCAUCCACUUCUGGGCUGCGUCCACAGGCACAGCUGGUUUGAGCAUUUUGACCGAAUUGCCAAACCACUCGUGCCUGGAGCCACAGCCUGCACCUGCUCCUGAGUCCUCUGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 AUGGUUUGCAUCCACUUCU-- C-| CCA - C A UUUUG GGGCUG GU CAGGCAC AG UGGUUUG GCA A UCCGAC CG GUCCGUG UC ACCAAAC CGU C UCUCCUGAGUCCUCGUCCACG AC^ AG- C - - UAAGC 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Ete-Mir-6715_5p (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- ACAGGCACAGCUGGUUUGAGCA -22
Get sequence
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Co-mature sequence | Ete-Mir-6715_3p (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
36- CCAAACCACUCGUGCCUGGAG -57
Get sequence
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