| MirGeneDB ID | Ocu-Mir-448 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-448 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Rabbit (Oryctolagus cuniculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | ocu-mir-448 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-448 Cfa-Mir-448 Cja-Mir-448 Cpo-Mir-448 Eca-Mir-448 Ete-Mir-448 Hsa-Mir-448 Laf-Mir-448 Mml-Mir-448 Mmr-Mir-448 Mmu-Mir-448 Pab-Mir-448 Rno-Mir-448 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (oryCun2_add) |
chrX: 63272622-63272701 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UGCAUAU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GCAGUUAACCUUCACAUGGGCAGGAAGGUUGAACAUCCUGCAUAGUGCUGCCAAGAAAUCCCUAUUUCAUACCAAGAGGGGGCUGGCUGGUUGCAUAUGUAGGAUGUCCCAUCUCCCAGCCCACUUCAUCAUGCCAGACAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 70 GCAGUUAACCUUCACAU-| A A UGA G U AAGAAAUCCCUAUUUCA GGGC GG AGGU ACAUCCUGCAUA UGC GCC U CCCG CC UCUA UGUAGGAUGUAU ACG UGG A ACAGACCGUACUACUUCA^ A C CCC - U UCGGUCGGGGGAGAACC . 130 120 110 100 90 80 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Yes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UG at 5p(-14), CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Ocu-Mir-448_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | MIMAT0048451 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- GAACAUCCUGCAUAGUGCUGCC -22
Get sequence
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| Mature sequence | Ocu-Mir-448_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0048452 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
60- UUGCAUAUGUAGGAUGUCCC -80
Get sequence
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