| MirGeneDB ID | Ocu-Mir-2355 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-2355 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Rabbit (Oryctolagus cuniculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | ocu-mir-2355 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-2355 Cfa-Mir-2355 Cja-Mir-2355 Cpo-Mir-2355 Dno-Mir-2355 Ete-Mir-2355 Hsa-Mir-2355 Laf-Mir-2355 Mml-Mir-2355 Mmr-Mir-2355 Pab-Mir-2355 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (oryCun2_add) |
chr7: 147915972-147916038 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UCCCCAG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UGCAUAUAAAAUAACAUUGUCAGACAUGUCAUCCCCAGAUACAAUGGACAAUAUGCUAUUAUAAUUGUAUGGCAUUGUCCUUGCUGUUUGCAGAUAAUACUGCUGACAUUAUUCCUCUCAUACAUGUGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 UGCAUAUAAAAUAACAU-- A - C CC -| U AUGCUAUUAU UGUCAG CA UGU AUC CAGAUA CAA GGACAAU \ ACAGUC GU AUA UAG GUUUGU GUU CCUGUUA A UGUACAUACUCUCCUUAUU - C A AC C^ - CGGUAUGUUA 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Ocu-Mir-2355_5p (predicted) |
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| mirBase accession | MIMAT0048603 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AUCCCCAGAUACAAUGGACAAU -22
Get sequence
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| Co-mature sequence | Ocu-Mir-2355_3p (predicted) |
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| mirBase accession | MIMAT0048604 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
45- UGUCCUUGCUGUUUGCAGAUAA -67
Get sequence
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